Segundo a agência Lusa, o ferry Virgo Transport 8 transportava 213 passageiros e 30 tripulantes e tinha partido, no sábado, de Surabaya, em Java, com destino a Banjarmasin, no Bornéu.
A embarcação perdeu contacto durante a madrugada de domingo.
O chefe da Agência Nacional de Busca e Salvamento da Indonésia, Mohammad Syafii, confirmou um balanço de seis mortos, 129 desaparecidos e 108 sobreviventes.
Para as operações de resgate foram mobilizadas cinco aeronaves e 17 embarcações, incluindo unidades da Marinha indonésia.
As equipas de busca estão concentradas em seis sectores, com prioridade para a localização de pessoas que possam estar à superfície.
Mergulhadores e drones subaquáticos deverão igualmente ser utilizados nas buscas no interior e nas proximidades da embarcação, que já foi localizada.
O ministro dos Transportes da Indonésia, Dudy Purwagandhi, afirmou que o ferry não estava sobrelotado, uma vez que transportava menos passageiros do que a sua capacidade máxima de 500 pessoas.
No entanto, a embarcação terá enfrentado condições marítimas adversas, com ondas superiores a 2,5 metros.
Os acidentes marítimos são frequentes na Indonésia, um arquipélago composto por mais de 17 mil ilhas e fortemente dependente do transporte marítimo.
Em 2018, mais de 150 pessoas morreram num naufrágio ocorrido num lago da ilha de Sumatra, num dos acidentes marítimos mais graves registados no país nos últimos anos.